Apoyo al gobierno de Colombia: Este apoyo se realiza directamente con la ACR, no obstante también implica actividades complementarias como:
- Apoyo en el montaje de 31 Centros de Servicios.
- El apoyo en el diseño e implementación de una estrategia de comunicaciones que busca crear un entorno de opinión pública que facilite el buen desarrollo del proceso.
- Apoyo en el Seguimiento y Monitoreo de los participantes del proceso: El Sistema de Acompañamiento, Monitoreo y Evaluación, SAME, se ha consolidado como el sistema de información de la ACR y permite hacer un acompañamiento permanente al proceso de reintegración. A través del SAME se ha logrado establecer rutas de atención que permiten la visita periódica a prácticamente todos los municipios donde se encuentran los desmovilizados; avanzar en la ubicación de desmovilizados; facilitar la obtención del conocimiento sobre las necesidades y dificultades de los desmovilizados en su proceso de reintegración; priorizar las necesidades del proceso y acompañar a los beneficiarios con un grupo de profesionales dispuestos a apoyarlos en sus avances y resolver sus dificultades.
Apoyo a la Población desmovilizada: Una vez el beneficiario ha iniciado el proceso de inserción social y ha demostrado su interés en acogerse a las exigencias y requerimientos de la ACR, él o ella son considerados elegibles para una asistencia más permanente en el proceso de reintegración económica. El apoyo se basa en la estructuración de proyectos en las siguientes líneas:
- Desarrollo Humano: a través de la realización de acompañamiento psicosocial y formación socio-empresarial a beneficiarios.
- Formación académica: a través de becas de educación superior para estudios técnicos, tecnológicos o universitarios.
- Formación ocupacional: a través del desarrollo de perfiles laborales (15.000 realizados a diciembre de 2008) y el establecimiento y seguimiento a los procesos de entrenamiento y formación laboral.
- Proyectos Productivos y Empleabilidad: Definición y concreción de alternativas sostenibles de generación de ingresos en las regiones asignada que se desarrollan en alianza con el sector público y privado.
Apoyo a las víctimas de los grupos armados ilegales: El Programa apoya al gobierno de Colombia en el desarrollo de la Ley de Justicia y Paz promoviendo la reconciliación y los procesos de reparación simbólicos y colectivos a víctimas de la violencia.
Con la Comisión Nacional de Reparación y Reconciliación (CNRR) se trabaja en:
- Realización de consultas sociales y jornadas de atención enfocadas a la difusión y el acceso de las víctimas a la verdad, la justicia y la reparación
- Apoyo al proceso de reparación colectiva y a la formulación del Plan Nacional de Reparación Colectiva, a través de ocho casos emblemáticos.

- Montaje y fortalecimiento de 9 oficinas regionales (Antioquia, Centro, Nororiente, Barranquilla, Sincelejo, Valledupar, Valle del Cauca, Quibdó y Pasto) para atención de víctimas y apoyo administrativo a la sede central.
- Difusión e implementación de la ruta jurídica [AC2] para facilitar el acceso de las víctimas a la reparación integral, a través de herramientas como el "Manual para Orientar la Intervención Legal de las Víctimas en el Marco de la Ley de Justicia y Paz".
- Asistencia técnica en formación y fortalecimiento institucional y en el desarrollo de procesos de planificación y documentación de procesos pertinentes al accionar de las áreas sustantivas y mecanismos operativos para el trabajo con victimas
- Apoyo al Modelo de Atención Integral a Víctimas puesto en marcha en los departamentos de Santander y Magdalena.
Así mismo, se apoya al Comité de Justicia y Paz compuesto por la Fiscalía General de la Nación, a la Procuraduría, la Defensoría, el Ministerio del Interior y de Justicia, Acción Social , El Consejo Superior de la Judicatura, la Superintendencia de Notariado y Registro y la CNRR en el desarrollo de un Sistema Interinstitucional de Justicia y Paz.
La Fiscalía General de la Nación también ha recibido el apoyo de la OIM para la creación de equipos de atención psicosocial a las víctimas, el diligenciamiento del Formulario de Registro de Hechos y para facilitar la asistencia de la víctimas a las versiones libres. Con esa institución se han realizado 14 Jornadas de Identificación de Familiares de Desaparecidos, en las que se reúnen pruebas documentales y de ADN para agilizar el proceso de identificación de los restos óseos encontrados en fosas comunes y se han apoyado 17 ceremonias de entrega de restos óseos beneficiando a más de 300 familias de las personas víctimas de desaparición forzada.
El Programa de Reparación Individual por Vía Administrativa, iniciado en agosto de 2008 bajo el liderazgo de la Agencia Presidencial para la Acción Social y la Cooperación, Acción Social, ha contado con el apoyo de la OIM en el desarrollo temporal de una base de datos y en el proceso de recepción, sistematización y verificación de las Solicitudes de Reparación Administrativa.